Изменене прозрачности элемента это очень интересный, и частоприменяющийся эффект.
Делается он чаще всего через метод jQuery animate, который меняет css-свойства, в том числе opacity.
Все бы ничего, но наши любимые братья ишаки седьмой версии и ниже не поддерживают opacity и там это не работает.
Можно конечно поискать где-то скрипты, которые решают эту проблему, можно для ишаков каким-то образом использовать фильтр DxTransform, но к счастью все уже решено за нас.
В jQuery есть замечательный метод fadeTo
Это замечательный маленький пример, чтобы было понятно о чем речь:
<script type="text/javascript">// <![CDATA[
$('#selector').click(function(){ $(this).fadeTo('slow', '0.3'); })
// ]]></script>
В данном случае элемент с выбранным селектором сменит прозрачность, прозрачность можно менять в любую сторону и с любой скоростью, здесь думаю лучше всего почитать описание метода по ссылке, которая была выше.